أصدر الدكتور محمد معيط وزارة المالية قرارًا باعتبار دائرة جمركية مطار برنيس الدولى على البحر الأحمر بمساحة إجمالية 185509.44م2 تقريبًا (فقط مائة وخمسة وثمانون ألفًا وخمسمائة وتسعــة أمتار مربعة وأربعــة وأربعــون سنتيمترًا مربعًا تقريبًا) وهى عبارة عن مستطيلين الشكل، ويتكون المطار من (1) صالة سـفـر داخـلى ودولى (2) صالة وصول داخلى ودولى (3) صالة سفر ووصول VIP (4) مهبط الطائرات والترمك الخاص بـه.

ويحتوى المطار على مكاتب إدارية مخصصة لجهات مختلفة من طابقين "أرضى وأول" وهى خارج الدائرة الجمركية ويوجد بوابتان رئيسيتان لصالتى السفر والوصول على الحد الشرقى للمطار ويوجد أمام كل منهما صالتا استقبال ومودعين وهما خارج الدائرة الجمركية ، وذلك على النحو الموضح بالرسم الهندسى ومحضرى المعاينة.

قرار وزيـر المـاليـة جاء بناء على على محضر المعاينة الجمركية المبدئى المؤرخ 2020/10/29 وعلى تقرير أعمال لجنة المعاينة الجمركية المؤرخ 2021/1/12 وعلى محضر المعاينة الجمركية النهائى المؤرخ 2021/3/1 وعلى كتاب رئيس مجلس إدارة الشركة المصرية للمطارات المؤرخ 2021/3/25 والمتضمن تعهد الشركة بتقديم ما يفيد الحراسة الشرطية للمطار على مدار 24 ساعة وتقديم موافقة الحماية المدنية وذلك فى حال البدء فى تشغيل المطار وعلى كتاب رئيس الإدارة المركزية لشئون مكتب وزير الطيران المدنى وعلى ما عرضه رئيس مصلحة الجمارك. 

كما تقرر أن تلتزم وزارة الطيران المدنى بالتنسيق مع الأجهزة المختصة بوزارة الداخلية لتوفير الحماية المدنية وتأمين الدائرة الجمركية المحددة بالمادة الأولى من هذا القرار على مدار 24 ساعة يوميًا، وذلك بموافقة مصلحة الجمارك بما يفيد موافقة إدارة الحماية المدنية على التشغيل عقب المعاينة النهائىة وما يفيد الحراسة الشرطية للمطار على مدار 24 ساعة ، وذلك خلال مدة ثلاثة أشهر من تاريخ نشر القرار، وحال عدم تنفيذ الاشتراطات خلال تلك المدة يتم وقف النشاط .

وأن تلتزم وزارة الطيران المدنى بالتنسيق مع الأجهزة المختصة بوزارة الاتصالات وتكنولوجيا المعلومات لتوفير الربط الآلى للدائرة الجمركية المحددة بالمادة الأولى من هذا القرار وذلك بموافاة مصلحة الجمارك بما يفيد تمام الربط الآلى معها، وذلك خلال مدة ثلاثة أشهر من تاريخ نشر هذا القرار ، وحال عدم تنفيذ تلك الاشتراطات خلال تلك المدة يتم وقف النشاط.